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隨著水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展，水產(chǎn)養(yǎng)殖單位產(chǎn)量大幅度提高，但水質(zhì)污染嚴(yán)重，特別是飼養(yǎng)后期，水中有機(jī)物、氨及亞硝酸鹽含量偏高，嚴(yán)重影響了魚的生長(zhǎng)。光合菌施入水體后，它可降解水體中的殘存飼料、魚類的糞便及其它有機(jī)物；同時(shí)，還能吸收利用水體中的氨、亞硝酸鹽、硫化氫等有害物質(zhì)。施用光合菌，能有效避免固體有機(jī)物和有害物質(zhì)的積累，起到凈化水質(zhì)的作用。

在水產(chǎn)養(yǎng)殖中運(yùn)用的光合菌主要是光能異養(yǎng)型紅螺菌科(Rhodospirillaceae)中的一些品種，例如沼澤紅假單胞菌(Rhodop seudanonas palustris)；

在自然界淡、海水中通常每毫升含有近百個(gè)PSB菌，光合菌的菌體以有機(jī)酸、氨基酸、氨和醣類等有機(jī)物和硫化氫作為供氧體，通過光合磷酸化獲得能量，在水中光照條件下可直接利用降解有機(jī)質(zhì)和硫化氫并使自身得以增殖，同時(shí)凈化了水體。

飼料添加劑

光合菌是一種營(yíng)養(yǎng)豐富、營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高的細(xì)菌，菌體含有豐富的氨基酸、、b族維生素，尤其是12和含量較高，還有生理活性物質(zhì)輔酶Q。光合菌的體積為小球藻的二十分之一，特別適合作為剛孵出仔魚的開口餌料。使用光合菌作為開口餌料，可大幅度提高魚苗成活率。光合菌還可作為飼料添加劑添加在飼料中，光合菌所含的酶類，可以促進(jìn)魚類對(duì)飼料的消化吸收，提高飼料利用率，降低餌料系數(shù)，同時(shí)還可顯著提高魚的生長(zhǎng)速度。