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　　二代測序技術(shù)以其短讀長、高通量、準確性高的特點，仍在測序市場上占優(yōu)勢地位。以Illumina Solexa為例，首先利用超聲波將DNA打斷成200-500bp小片段文庫，加接頭后DN段隨機附著于flowcell表面，經(jīng)過橋式PCR擴增形成“DNA簇"，實現(xiàn)堿基信號強度放大，采用邊合成邊測序的方法，進行全基因組全面，準確的測序。

　　圖1 Hiseq Xten (左) 與 NovaSeq 6000（右）

　　2014年Illumina推出HiSeq X Ten測序儀，它利用數(shù)十億個納米孔的流動槽，較大縮短了測序周期。2017年它又推出了新一代測序儀NovaSeq系列，我們以相同文庫分別進行Hiseq Xten系列和NovaSeq系列測序，DNA重測序產(chǎn)出數(shù)據(jù)指標如下：

　　表1 DNA重測序結(jié)果比較

　　看完重測序，再看看轉(zhuǎn)錄組文庫測序比較：

　　表2轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果比較

　　基于以上結(jié)果，圖譜君總結(jié)了以下幾點：

　　1.測序原理：X-ten與Nova6000測序原理均是基于solexa的邊合成邊測序的原理；Nova6000采用Illumina的EX-AMP簇生成技術(shù)，以及新一代的Patterned Flow Cell。

　　2.Q30質(zhì)量值：在實際測序中Nova6000的Q30相對于X-ten更穩(wěn)定且測序時長更短，試劑衰減對質(zhì)量影響更小，整體的Q30 Nova6000要優(yōu)于X-ten。

　　3.測序方式：受限于X-ten的控制軟件以及試劑等因素，X-ten只能進行單Index的測序識別；而Nova6000可以進行I7 I5雙端Index的測序，理論上可以做到更的識別。

　　4.DNA文庫冗余度：Nova6000明確優(yōu)于X-ten平臺。