Ion S5系統(tǒng)主要性能
? 無需復(fù)雜的光路系統(tǒng)， Ion Torrent半導(dǎo)體測序技術(shù)利用天然核苷酸反應(yīng)， 實現(xiàn)高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測靈敏度來探測低頻變異。
? 相比市場上其他基于光學(xué)檢測技術(shù)的測序平臺， IonS5系統(tǒng)幫助希望引入新一代測序技術(shù)的實驗室降低初期投入成本。
? 支持多種不同價格和通量的半導(dǎo)體芯片(Ion 510 Ion 520 Ion 530?和Ion 540?芯片)， 從而為用戶開展各類DNA/RNA測序應(yīng)用項目提供更大的靈活性。
? 提供快的新一代測序儀運行速度。
? 依托用戶與技術(shù)社區(qū)-Ion社區(qū)(IonCommunity)-這一社區(qū)目前已擁有超過3萬名會員，會員人數(shù)仍在每天增長中。
? 較小的桌面占用空間， 僅需不到0.5平方米 (儀器尺寸：54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
? 提供廣泛的文庫制備方案與試劑盒選擇， 操作簡單、快速， 起始樣品需求量極低， 適用于微生物測序、靶向基因測序、 外顯子組測序， 以及RNA測序等廣泛研究應(yīng)用。
? 與Ion Chef?系統(tǒng)或Ion OneTouch? 2系統(tǒng)配合使用， 實現(xiàn)簡易快速的模板制備。
? 通過整合的T630服務(wù)器與Torrent Suite?軟件， 實現(xiàn)從堿基識別到變異解析的完整解決方案。
? 運用Ion Reporter?軟件對配對樣品DNA變異的檢測和分析， 提供簡易和整合的三級數(shù)據(jù)分析工具。
系統(tǒng)流程、 技術(shù)參數(shù)與應(yīng)用
| 性能 | 描述 |
| 簡捷的靶向測序流程 | "簡單、 快速的自動化工作流程： 靶向測序應(yīng)用中， 從DNA樣品輸入到獲 得分析數(shù)據(jù)*的完整過程中手工操作不到45分鐘" |
| ? 文庫制備： – Ion Xpress Plus片段文庫試劑盒： 15分鐘(手工操作時間) – 使用AB Library Builder實驗方案實現(xiàn)自動化文庫制備(13份樣品)： 10分鐘(手工操作時間) – Ion AmpliSeq靶向富集和建庫技術(shù)： ? 手動建庫方案： 60分鐘(手工操作時間) ? Ion Chef系統(tǒng)自動化建庫方案： 15分鐘(手工操作時間) ? 模板制備： – Ion OneTouch 2系統(tǒng)： 模板擴增， 手工操作時間2.5小時 – Ion Chef系統(tǒng)： 模板擴增與芯片上樣， 手工操作時間15分鐘 ? 測序： – 手工操作時間少于15分鐘 ? 數(shù)據(jù)分析： – 從5百萬讀值數(shù)據(jù)(200 bp測序反應(yīng))獲得比對好的BAM文件， 操作時間不到5小時" | |
| 快速的新一代測序 | 從DNA樣品到獲得變異結(jié)果快僅需兩個工作日(8小時計算) |
? 測序反應(yīng)僅需2.5-4小時即可完成
? 使用Ion Xpress Plus片段文庫試劑盒時， 基因組DNA與擴增文庫制備僅需2.5小時； 使用Ion AmpliSeq靶向富集技術(shù)時， 僅需3.5個小時 ? 在Ion Chef系統(tǒng)上， 自動對兩塊Ion S5芯片進行模板制備與芯片上樣 ? 在Ion S5 Torrent服務(wù)器上進行數(shù)據(jù)分析， 數(shù)小時之內(nèi)完成變異檢測報告
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| 高度靈活的通量 | 四款芯片分別提供從2百萬至8千萬的序列通量， 用戶可以根據(jù)需求靈活選擇 |
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| 每周樣品通量高 | 每周可完成更多數(shù)量樣品的完整靶向測序工作流程 |
| ? 模塊化工作流程設(shè)計， 支持用戶每周(5個工作日)進行多次測序 每臺Ion S5系統(tǒng)每周可完成多達10次測序(200堿基讀值) ? 模塊化工作流程， 研究人員能夠在一臺Ion S5系統(tǒng)上多可同時操作384份標(biāo)記樣品， 每周多可檢測3840份獨立DNA樣品 * 工作日以8小時計算。 | |
| 簡捷、 直觀的系統(tǒng) | 盒裝試劑與友好的用戶界面， 為用戶提供一個簡捷的測序流程 |
| ? 在Ion Chef系統(tǒng)、 Ion OneTouch 2系統(tǒng)和Ion S5系統(tǒng)上， 用戶可使用直觀的觸摸界面進行編程和操控 ? 用戶可通過固定或移動設(shè)備(如iOS和Android設(shè)備)遠程監(jiān)控Ion S5測序儀 ? 行業(yè)標(biāo)準數(shù)據(jù)格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF)， 兼容第三方生物信息學(xué)軟件提供的下游分析和可視化工具。 ? 模塊化工作流程， 可在文庫制備到測序的每一個環(huán)節(jié)中實施質(zhì)量控制， 幫助用戶節(jié)約時間， 降低試劑成本。 ? 通過盒裝試劑與完整樣品跟蹤功能(RFID掃描)優(yōu)化流程， 提高效率 | |
| 長堿基讀長 | ? 200-、 400-與600-堿基讀長 ? 兼容長mate-pair讀長賽默飛 Ion GeneStudio S5 系列基因測序儀 |
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