Ion S5系統(tǒng)主要性能
? 無(wú)需復(fù)雜的光路系統(tǒng)， Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序技術(shù)利用天然核苷酸反應(yīng)， 實(shí)現(xiàn)高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測(cè)靈敏度來(lái)探測(cè)低頻變異。
? 相比市場(chǎng)上其他基于光學(xué)檢測(cè)技術(shù)的測(cè)序平臺(tái)， IonS5系統(tǒng)幫助希望引入新一代測(cè)序技術(shù)的實(shí)驗(yàn)室降低初期投入成本。
? 支持多種不同價(jià)格和通量的半導(dǎo)體芯片(Ion 510 Ion 520 Ion 530?和Ion 540?芯片)， 從而為用戶(hù)開(kāi)展各類(lèi)DNA/RNA測(cè)序應(yīng)用項(xiàng)目提供更大的靈活性。
? 提供快的新一代測(cè)序儀運(yùn)行速度。
? 依托用戶(hù)與技術(shù)社區(qū)-Ion社區(qū)(IonCommunity)-這一社區(qū)目前已擁有超過(guò)3萬(wàn)名會(huì)員，會(huì)員人數(shù)仍在每天增長(zhǎng)中。
? 較小的桌面占用空間， 僅需不到0.5平方米 (儀器尺寸：54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
? 提供廣泛的文庫(kù)制備方案與試劑盒選擇， 操作簡(jiǎn)單、快速， 起始樣品需求量極低， 適用于微生物測(cè)序、靶向基因測(cè)序、 外顯子組測(cè)序， 以及RNA測(cè)序等廣泛研究應(yīng)用。
? 與Ion Chef?系統(tǒng)或Ion OneTouch? 2系統(tǒng)配合使用， 實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)易快速的模板制備。
? 通過(guò)整合的T630服務(wù)器與Torrent Suite?軟件， 實(shí)現(xiàn)從堿基識(shí)別到變異解析的完整解決方案。
? 運(yùn)用Ion Reporter?軟件對(duì)配對(duì)樣品DNA變異的檢測(cè)和分析， 提供簡(jiǎn)易和整合的三級(jí)數(shù)據(jù)分析工具。
系統(tǒng)流程、 技術(shù)參數(shù)與應(yīng)用
| 性能 | 描述 |
| 簡(jiǎn)捷的靶向測(cè)序流程 | "簡(jiǎn)單、 快速的自動(dòng)化工作流程： 靶向測(cè)序應(yīng)用中， 從DNA樣品輸入到獲 得分析數(shù)據(jù)*的完整過(guò)程中手工操作不到45分鐘" |
| ? 文庫(kù)制備： – Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒： 15分鐘(手工操作時(shí)間) – 使用AB Library Builder實(shí)驗(yàn)方案實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化文庫(kù)制備(13份樣品)： 10分鐘(手工操作時(shí)間) – Ion AmpliSeq靶向富集和建庫(kù)技術(shù)： ? 手動(dòng)建庫(kù)方案： 60分鐘(手工操作時(shí)間) ? Ion Chef系統(tǒng)自動(dòng)化建庫(kù)方案： 15分鐘(手工操作時(shí)間) ? 模板制備： – Ion OneTouch 2系統(tǒng)： 模板擴(kuò)增， 手工操作時(shí)間2.5小時(shí) – Ion Chef系統(tǒng)： 模板擴(kuò)增與芯片上樣， 手工操作時(shí)間15分鐘 ? 測(cè)序： – 手工操作時(shí)間少于15分鐘 ? 數(shù)據(jù)分析： – 從5百萬(wàn)讀值數(shù)據(jù)(200 bp測(cè)序反應(yīng))獲得比對(duì)好的BAM文件， 操作時(shí)間不到5小時(shí)" | |
| 快速的新一代測(cè)序 | 從DNA樣品到獲得變異結(jié)果快僅需兩個(gè)工作日(8小時(shí)計(jì)算) |
? 測(cè)序反應(yīng)僅需2.5-4小時(shí)即可完成
? 使用Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒時(shí)， 基因組DNA與擴(kuò)增文庫(kù)制備僅需2.5小時(shí)； 使用Ion AmpliSeq靶向富集技術(shù)時(shí)， 僅需3.5個(gè)小時(shí) ? 在Ion Chef系統(tǒng)上， 自動(dòng)對(duì)兩塊Ion S5芯片進(jìn)行模板制備與芯片上樣 ? 在Ion S5 Torrent服務(wù)器上進(jìn)行數(shù)據(jù)分析， 數(shù)小時(shí)之內(nèi)完成變異檢測(cè)報(bào)告
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| 高度靈活的通量 | 四款芯片分別提供從2百萬(wàn)至8千萬(wàn)的序列通量， 用戶(hù)可以根據(jù)需求靈活選擇 |
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| 每周樣品通量高 | 每周可完成更多數(shù)量樣品的完整靶向測(cè)序工作流程 |
| ? 模塊化工作流程設(shè)計(jì)， 支持用戶(hù)每周(5個(gè)工作日)進(jìn)行多次測(cè)序 每臺(tái)Ion S5系統(tǒng)每周可完成多達(dá)10次測(cè)序(200堿基讀值) ? 模塊化工作流程， 研究人員能夠在一臺(tái)Ion S5系統(tǒng)上多可同時(shí)操作384份標(biāo)記樣品， 每周多可檢測(cè)3840份獨(dú)立DNA樣品 * 工作日以8小時(shí)計(jì)算。 | |
| 簡(jiǎn)捷、 直觀的系統(tǒng) | 盒裝試劑與友好的用戶(hù)界面， 為用戶(hù)提供一個(gè)簡(jiǎn)捷的測(cè)序流程 |
| ? 在Ion Chef系統(tǒng)、 Ion OneTouch 2系統(tǒng)和Ion S5系統(tǒng)上， 用戶(hù)可使用直觀的觸摸界面進(jìn)行編程和操控 ? 用戶(hù)可通過(guò)固定或移動(dòng)設(shè)備(如iOS和Android設(shè)備)遠(yuǎn)程監(jiān)控Ion S5測(cè)序儀 ? 行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF)， 兼容第三方生物信息學(xué)軟件提供的下游分析和可視化工具。 ? 模塊化工作流程， 可在文庫(kù)制備到測(cè)序的每一個(gè)環(huán)節(jié)中實(shí)施質(zhì)量控制， 幫助用戶(hù)節(jié)約時(shí)間， 降低試劑成本。 ? 通過(guò)盒裝試劑與完整樣品跟蹤功能(RFID掃描)優(yōu)化流程， 提高效率 | |
| 長(zhǎng)堿基讀長(zhǎng) | ? 200-、 400-與600-堿基讀長(zhǎng) ? 兼容長(zhǎng)mate-pair讀長(zhǎng)賽默飛ABI Ion GeneStudioS5XL系列基因測(cè)序儀 |
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